Ruského veľvyslanca v Turecku Andreja Karlova zastrelil 19. decembra 2016 na výstave fotografií v Ankare turecký policajt v civile. Páchateľa na mieste činu zabila polícia. Tureckí predstavitelia tvrdia, že strojcom atentátu bol práve Gülen a cieľom tohto činu bolo naštrbiť vzťahy medzi Tureckom a Ruskom. Deväť osôb po atentáte zatkli, ostatných, medzi nimi aj Gülena, súdia v neprítomnosti.
Prokuratúra žiada pre niektorých obvinených doživotné tresty a pre ostatných maximálne 15 rokov. Gülen zapojenie do vraždy veľvyslanca aj zorganizovanie pokusu o prevrat odmieta.